Rok pod znakiem samby

Styczeń

Piłkarze, którzy zostali w klubie po licznych grudniowych transferach, wyjeżdżają do Sao Paulo. Tam rozpoczynają przygotowania do nowego sezonu wraz z kilkunastoma nowymi kolegami z Brazylii pod okiem czeskiego trenera Bohumila Panika i Andrzeja Woźniaka. Łukasz Trałka zostaje wypożyczony doWidzewa Łódź, a Michał Łabędzki do ŁKS-u. W styczniu także ostatecznie upadają rozmowy transferowe na linii Pogoń – Wisła Kraków w sprawie Rafała Grzelaka i Przemysława Kaźmierczaka. Z Brazylii gruchnęła wieść: nowym trenerem Pogoni został Jose Carlos Serrao.

Luty

W Widzewie ląduje Bartosz Fabiniak. Trwa instalacja podgrzewanej murawy na szczecińskim stadionie. Nowym prezesem klubu zostaje Zbigniew Koźmiński, który zastępuje Krzysztofa Waszaka. Kontrakt z Pogonią podpisuje Brazylijczyk Amaral – były reprezentant kraju, poprzednio grający m.in. w Parmie i Fiorentinie. W meczu sparingowym Pogoń pokonuje słynne FC Sao Paulo 2: 0. Drużyna opuszcza Brazylię i wyjeżdża na obóz do niemieckiego Barsinghausen, a następnie przyjeżdża do Polski, gdzie m. in. przegrywa sparing ze Śląskiem Wrocław 0:3. W szczecińskim LO1 odbywa się prezentacja zespołu.

Marzec
Przemysław Kaźmierczak otrzymuje piłkarskiego Oscara stacji Canal+ za najpiękniejszą bramkę roku (strzeloną Legii, mecz zakończył się wynikiem 2: 2). Trenerem Pogoni przestaje być Serrao – ponownie posadę obejmuje Panik. Drużyna przygotowuje się w Gutowie Małym pod Łodzią, a na pierwszy trening w Szczecinie przychodzi ponad tysiąc kibiców. Pogoń przegrywa pierwszy mecz w lidze 0: 3 u siebie z Amicą Wronki, w obecności kilkunastu tysięcy fanów. 99 urodziny obchodzi trener- -legenda Florian Krygier. Pod koniec miesiąca Pogoń notuje pierwszą wygraną – pokonuje 1: 0 Zagłębie Lubin. 31 marca umiera Florian Krygier.

Kwiecień

Nowym trenerem Pogoni zostaje Mariusz Kuras. Pogoń obchodzi 58. urodziny. Seria porażek powoduje zmiany w składzie. Kontrakty rozwiązano z: Wagnerem, Juniorem, Fabio, Fabinho oraz Batatą II. Portowcy pokonują Odrę Wodzisław 1: 0 i zapewniają sobie utrzymanie w ekstraklasie.

Maj

Kazmierz Ćwikła zostaje prezesem Pogoni.

Czerwiec

Przemysław Kaźmierczak zostaje wypożyczony do portugalskiej Boavisty Porto, tym samym śladem wkrótce potem podąży Rafał Grzelak. Kontrakt rozwiązano z drugim trenerem – Andrzejem Woźniakiem. Z klubu odchodzi także Edi Andradina. Zespół pod okiem Kurasa rozpoczyna przygotowania do nowego sezonu. Przybyło kilku nowych graczy, a do Szczecina powrócił wychowanek morskiego klubu – Radosław Majdan, poprzednio broniący wWiśle Kraków.

Lipiec
Do Pogoni powrócił Edi Andradina, kontrakt rozwiązano za to z Grzegorzem Matlakiem. W wypadku samochodowym ciężko ranny zostaje trener grup młodzieżowych Włodzimierz Obst oraz jego wychowankowie. W meczu inaugurującym nowy sezon 2006/2007 Pogoń przegrywa w Łodzi z ŁKS-em aż 0: 4.

Sierpień

Z funkcji prezesa klubu rezygnuje Kazimierz Ćwikła. Jego miejsce ponownie zajmuje Krzysztof Waszak. Pogoń pokonuje po raz pierwszy w historii Górnika w Zabrzu i to aż 3:0. Na ulicach Szczecina pojawia się tramwaj wymalowany w barwy Pogoni. 41. urodziny obchodzi Mariusz Kuras. Przemysław Kaźmierczak otrzymuje powołanie do reprezentacji Polski.

Wrzesień

Piłkarze wracają do Szczecina, by tu, a nie w Gutowie Małym, trenować na co dzień. Do zespołu wraca Amaral, który miał odejść z powodu kontuzji po poprzednim sezonie. W meczu 1/16 Pucharu Polski Pogoń pokonuje Lechię w Gdańsku 2: 0, a miejscowi kibice obrzucili bananami szczecińskich Brazylijczyków przed meczem. Skandal odbił się echem na całym świecie – zdjęcia z Gdańska opublikowała nawet największa gazeta w Sao Paulo. Powołania na mecze reprezentacji otrzymują Kaźmierczak oraz Grzelak.

Październik

Asysta Kaźmierczaka dała Polsce wygraną z Kazachstanem w eliminacjach mistrzostw Europy. W meczu Odra Wodzisław – Pogoń (2: 2) swojego pierwszego gola w karierze zdobył kapitan portowców – Julcimar. Radosław Majdan rozegrał natomiast mecz nr 300 w ekstraklasie. Pogoń odpada z rozgrywek o Puchar Polski po porażce w Poznaniu z Lechem (1: 2).

Listopad

Brazylijczyk Sergio Batata otrzymuje nadanie polskiego obywatelstwa. Rozlosowano grupy Pucharu Ekstraklasy, Pogoń wylosowała Lecha, Groclin i Arkę. 60 urodziny obchodzi legenda Pogoni Zenon Kasztelan. Pogoń przegrywa w ostatnim meczu rundy Orange Ekstraklasy w Bełchatowie z GKS-em 0: 1. Większość Brazylijczyków wyjeżdża na urlopy do ojczyzny, pozostałych kilku wraz z polskimi zawodnikami gra w Pucharze Ekstraklasy. Wyniki 0: 3 z Lechem, 0: 1 z Groclinem i 2: 2 z Arką nie mają większego znaczenia.

Grudzień
W meczu Polska – Zjednoczone Emiraty Arabskie debiutuje i zdobywa swego pierwszego gola w kadrze były obrońca Pogoni – Paweł Magdoń. Na stadionie przy ul. Twardowskiego rozpoczyna się instalacja telebimu. Klub rozwiązuje umowę z trenerem Mariuszem Kurasem. Jego następcą zostaje Libor Pala. Rafał Grzelak zdobywa swoje pierwsze gole w barwach Boavisty i dedykuje je nowonarodzonemu synkowi, Olivierowi.